Scuola Normale Superiore została założona w 1810 r. Na mocy dekretu Napoleona, jako bliźniacza instytucja École Normale Supérieure w Paryżu, której początki sięgają jurysdykcji rewolucji francuskiej. Termin „École Normale” („Scuola Normale”) został ukuty przez Josepha Lakanala, który, przedstawiając raport do Konwencji Narodowej w 1794 r. W imieniu Komitetu Instrukcji Publicznych, wyjaśnił to w następujący sposób: „Normales: du latin norma, règle. Ces écoles doivent être en effet le type et la règle de toutes les autres ”.

Napoleon Przemyślałem projekt École Normale w 1808 r., ustanawiając w Paryżu siedzibę „Normale”, aby pomieścić młodych studentów i szkolić ich w sztuce nauczania humanistyki i nauk ścisłych. Projekt został powtórzony w Toskanii dekretem z dnia 18 października 1810 r. Z fundacją w Pizie, siedzibą jednej z akademii uniwersytetu cesarskiego, oddziału École Normale Supérieure w Paryżu, zwanego Scuola Normale Superiore.

Kiedy w 1814 roku Ferdynand III, Wielki Książę Toskanii powrócił do Toskanii, projekt Scuola Normale w Pizie przestał istnieć. Dopiero na początku lat 40. XIX w., W związku z reformą uniwersytecką z lat 1839-1841, wznowiono projekt. Pytanie to zostało połączone z propozycjami wznowienia działalności edukacyjnej starożytnego Zakonu Świętego Szczepana, którego główne założenia mieściły się w Palazzo della Carovana w Pizie. 28 listopada 1846 r. Wielki książę motu proprio założył toskańską Scuola Normale w Pizie (nazywaną także Cesarskim Królewskim Scuola Normale, ponieważ była powiązana z systemem austriackim), zarówno pod względem teoretycznym, jak i praktycznym, pod patronatem Zakon Świętego Szczepana, ale w zależności od Uniwersytetu w Pizie.
17 października 1862 r. minister edukacji Królestwa Włoch Carlo Matteucci wprowadził nowe przepisy w dekrecie, który przekształcił instytucję w słynną „Szkołę Normalną Królestwa Włoch”. Miał być organiczny podział na dwa wydziały, sztuki i nauki.

W 1863 r. został nowym dyrektorem Scuola Normale, szanowanego Pasquale Villari. Villari opuścił Scuola w 1865 r., A jego miejsce zajął matematyk Enrico Betti; od 1890 do 1900 r. stanowisko dyrektora wypełniał historyk literatury Alessandro d'Ancona, a od 1900 do 1918 r. matematyk Ulisse Dini. Nowe przepisy, wydane przez ministra Michele Coppino w 1877 r., Dokonały przeglądu i uproszczenia wewnętrznych przepisów dotyczących studiów i zostały zrównane z organizacyjnego punktu widzenia.

Filozof Giovanni Gentile został umieszczony na czele Scuola Normale jako komisarz w 1928 r. i jako dyrektor w 1932 r. Wydał teren Scuola Normale, Palazzo dei Cavalieri, a także ogłosił nowy statut w 1932, który uznał Scuola Normale za zaawansowany instytut edukacyjny z „statusem prawnym i autonomią administracyjną, edukacyjną i dyscyplinarną”, zapewniający autonomię na Uniwersytecie w Pizie. Ponadto zreformował Scuola, nadał mu formalną autonomię i dążył do ekspansji na inne dyscypliny, z utworzeniem Collegio Mussolini per le Scienze Corporative (1931) i Collegio Nazionale Medico (1932). Nowe kolegia zostały później połączone w Collegio Medico-Giuridico, które nadal działało (w dziedzinie prawa i medycyny) pod jurysdykcją Scuola Normale Superiore di Pisa.

W okresie powojennym było wiele trudności praktycznych; jednak oprócz restauracji Palazzo dei Cavalieri. Scuola Normale w 1951 r., Założył szkołę z internatem Antonio Pacinotti, zarezerwowaną dla studentów wydziałów rolnictwa, ekonomii i inżynierii, z planami dalszego otwarcia również na inne wydziały. W 1967 r. Scuola Superiore di Studi Universitari e Perfezionamento połączyła Scuola per le Scienze Applicate A. Pacinotti (założona w 1951 r.) Z Collegio Medico-Giuridico tworzącą Sant'Anna School of Advanced Studies. Nowa instytucja, choć nadal jest wierna modelowi ustanowionemu przez Scuola Normale Superiore di Pisa, była administrowana przez Uniwersytet w Pizie. W 1987 r. Sant'Anna School of Advanced Studies uzyskała pełną niezależność (ustawa z 14 lutego 1987 r., Nr 41) i utrzymuje silne powiązania zarówno ze Scuola Normale Superiore di Pisa, jak i Uniwersytetem w Pizie tworzącym system uniwersytecki w Pizie.

Z upływem czasu Scuola Normale coraz bardziej otwiera się na społeczeństwo i pozostając elitarnym instytutem, oferuje swoją działalność kulturalną i dziedzictwo coraz szerszej publiczności